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手术麻醉损伤记忆力的分子机制研究

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麻醉会影响记忆力?答案是肯定的。

在协助南方科技大学的一个课题项目进行分析的过程中,我们通过比较使用异丙酚进行麻醉的老鼠的表达芯片数据,获取了异丙酚作用下,脑海马区的差异表达基因列表,并进行了生物功能富集分析,结果发现,这些基因主要是和神经突触的塑化过程有关,也参与包括大脑皮层发育,学习记忆以及行为形成相关的过程。进一步通过PAS算法,发现这些功能均在麻醉刺激下被抑制,进而造成对记忆力的损伤。


客户进而希望知道这些基因是被哪些miRNA调控的,可以进行实验验证,从下列显著相关的生物过程中,我们和客户一起选取了4项进行后续分析

四项分析.png


通过omicsbean(www.omicsbean.cn) ‘基因找miRNA’功能,我们帮助客户对其关注的7个基因在miRbase v21, mirTarbase, miRanda 2010, miRbase v18, Tarbase5.0, targetscan v6.28个数据库中计算靶miRNA,并进行筛选:

a) 同时在2个以上数据库中存在互作

b) 异丙酚文献中未报道过的

c) 优先选择同时是两个以上基因共同的靶miRNA

d) 在人中存在同源的

结果,在所有备选986miRNA中,我们最终成功帮助用户筛选到一个同时符合4项需求的miRNA

整个课题项目的分析思路如下所示:

分析思路.png

GEO数据库通过移手术检索,到找到麻醉影响人体的中枢神经系统,行为意识以及大脑的发育,同样的思路和方法可以挖出更多的课题项目。如对分析有疑问可以关注下面微信号咨询

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